CAPÍTULO SOFTWARE INTERACTIVO
 DEL PROYECTO UBATIC 
EL LENGUAJE ESTEREOQUÍMICO DE LA VIDA - CBC 2015-2016 



 
 
 

En el capítulo de diseño de software didáctico interactivo dentro del proyecto UBATIC se pretende ilustrar sobre aspectos estadísticos espaciales del funcionamiento de un sistema biológico Sustrato-Enzima-Productos mediante una simulación didáctica informática interactiva.

INTRODUCCIÓN

 Para posibilitar la construcción de la simulación que cumpla con ciertos 
requisitos a saber:
  a- su realización con los recursos informáticos disponibles para la programación, 
  b- su realización con objetivos didácticos y 
  c- con una accesibilidad pública del software medianamente general,

planteando que  lo anterior resulte a través de:

  1- La ilustración gráfico bidimensional, informática interactiva, por la que se representan estados del sistema biológico mediante las ubicaciones y movimientos de los componentes Sustrato, Enzima, y Productos, quedando tal ilustración definida por medio de:

   - formas geométricas y colores distintos para cada componente, enzima, sustrato y productos 
   - las cantidades de cada componente
   - las velocidades de rotación y traslación de cada componente según condiciones 
   - dinámicas de choque y de reacción entre componentes en tanto aspectos cinemáticos y geométricos.
  - registro de sucesos con sus respectivos tiempos de reacción en archivo de texto acompañante.

   Respecto de estos aspectos cabe señalar que se han adecuado las velocidades de movimiento a los tamaños relativos de los componentes de reacción y se han establecido condiciones geométricas para definir cuándo hay reacción entre moléculas cercanas.

   2- Las necesarias simplificaciones además de permitir los adecuados desarrollos informáticos, facilitan el entendimiento de los aspectos principales del sistema biológico bajo estudio.

La primera simplificación es la reducción dimensional del espacio usual al plano gráfico obedeciendo ello al ahorro de recursos informáticos, pero también a facilitar la observación de los estados y de la dinámica del sistema.
 Otras simplificaciones atañen a las formas geométricas de las representaciones de los componentes para que sus reacciones se evidencien directamente.

Respecto de la dinámica de reacción se plantean ciertas simplificaciones, detallándose algunas: 
    Tomando en cuenta la relativamente pequeña cantidad de partículas respecto de los  sistemas reales se establece que el acople enzima sustrato se produzca cuando ambas moléculas esten tanto -cerca- como -orientadas correctamente- entre sí (es decir que la parte coloreada del sustrato apunte a la "boca" de entrada de la enzima) permitiéndose cierto margen de error tanto para la cercanía como para la coincidencia en la orientación angular correspondiente.

     3- La programación en entorno .net 2.0-3.5 y .net 4.0 de MSWindows resultando un software ejecutable en cualquier sistema Windows instalado y relativamente antiguo (Win XP - sp1 y posteriores), lo que facilita el acceso y uso relativamente general.

   Aprovechando las prestaciones de la interfaz gráfica Windows se han establecido controles para iniciar y reiniciar el proceso o las reacciones, y para la adaptación interactiva del tamaño de la ventana simulando aumento de concentraciones de reactivos.

 

 
 

LINKS DE DESCARGA DE LAS DOS VERSIONES

.NET 2.0-3.5 Y .NET 4.0

EnzimaSustratoProducto-.net20.exe

EnzimaSustratoProducto-.net40.exe

Instrucciones para el uso del software:

 Se arranca el programa,
 Una vez mezclados los reactivos se toca -REACCIÓN-,
 Cuando reaccionaron lo que interese, se puede parar con -no Reaccion-,
 Para recomenzar se toca -Reiniciar- y para congelar -pausa-.

 Cambiando el tamaño de ventana se simulan cambios de concentración.

 En la misma carpeta del ejecutable aparece un archivo de texto
 -TiemposReaccion.txt- que registra los tiempos de cada acople enzima-producto y el tamaņo de ventana cambiable.
  Este archivo se puede editar o  borrar para que aparezca uno nuevo.